Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL25A1Q9BXS0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms