Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAB11FIP5Q9BXF6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms