Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SALL3Q9BXA9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms