Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms