Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLF1Q9BQI6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms