Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LITAFQ99732 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms