Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CDRT15Q96T59 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDRT15Q96T59 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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