Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHAMP1Q96JM3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms