Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS39Q96JC1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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VPS39Q96JC1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VPS39Q96JC1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VPS39Q96JC1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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VPS39Q96JC1 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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VPS39Q96JC1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VPS39Q96JC1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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