Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C18orf8Q96DM3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C18orf8Q96DM3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms