Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HDAC11Q96DB2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms