Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAF2Q96CS3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAF2Q96CS3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms