Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC4Q8WW27 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms