Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00612Q8N6U2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms