Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HAPLN4Q86UW8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms