Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHA9Q7RTU4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms