Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TCF23Q7RTU1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms