Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTOP1Q7RTM1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms