Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NANOGP8Q6NSW7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms