Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CARMIL2Q6F5E8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CARMIL2Q6F5E8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms