Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL3Q6DD88 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms