Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD40Q6AI12 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms