Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ALFQ53S48 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms