Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDCCQ504Y2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms