Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC38Q502W7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms