Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DUSP28Q4G0W2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms