Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RRN3P1Q2M238 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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RRN3P1Q2M238 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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RRN3P1Q2M238 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RRN3P1Q2M238 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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