Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLPPQ16740 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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