Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
HIST3H3Q16695 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms