Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGCBQ16585 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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