Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNAPC1Q16533 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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