Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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GRIK5Q16478 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK5Q16478 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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