Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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