Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USF2Q15853 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms