Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
EFNB3Q15768 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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EFNB3Q15768 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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