Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIP13Q15645 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms