Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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