Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYTH1Q15438 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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