Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAM2Q15035 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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