Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNIP1Q15025 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms