Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCLAFQ15004 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms