Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMCO1Q147U7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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