Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCARF1Q14162 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCARF1Q14162 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms