Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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COL4A6Q14031 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COL4A6Q14031 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COL4A6Q14031 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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