Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ALCAMQ13740 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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