Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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DNASE1L3Q13609 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DNASE1L3Q13609 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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