Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TUBB3Q13509 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBB3Q13509 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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