Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XRCC4Q13426 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XRCC4Q13426 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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