Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SP140Q13342 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SP140Q13342 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP140Q13342 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP140Q13342 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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