Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SRSF6Q13247 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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